В 1925 году 180 пудов книг и 45 ящиков архивных материалов старой академии поступили на хранение в Военно-исторический архив. Генерал П. Ф. Рябиков писал, что «старая академия Генерального штаба, пережив столько тяжелых испытаний и проделав путь Петроград — Екатеринбург — Томск — Владивосток, умерла…». Однако наследие академии, ее музеи, библиотека, архив (среди которого — знаменитые воспоминания и дневники военного министра Д. А. Милютина, опубликованные только в наши дни) уцелели и остались в России.