Обратите внимание на то, что количество ссылок inode12 равно 2, потому что там есть две ссылки на дескриптор: одна для dir_1 в записях каталога для inode2, а вторая — свое же название (.) в его собственных записях каталога. Если вы создадите новый каталог dir_1/dir_3, количество ссылок для inode12 увеличится до трех, поскольку новый каталог будет содержать родительскую (..) запись, которая ссылается на inode12 так же, как родительская ссылка inode12 указывает на inode2.