Свадхиштхана оказывает важное влияние на репродуктивную и мышечную системы, системы выделения, деятельность селезенки и мочевого пузыря. Она связана также с ощущениями и эмоциями, наслаждением и сексуальностью. Красный цвет чакры согревает; он активизирует и пробуждает жизненную и физическую силы, служит для укрепления воли. Он активизирует глубокие страсти: любовь, секс, месть, ненависть, смелость.

Состояние этой чакры влияет на общее самочувствие и функции печени, надпочечников и поджелудочной железы.