В качестве главного администратора доходов федерального бюджета в части платы за негативное воздействие на окружающую среду определена Федеральная служба по надзору в сфере природопользования (Росприроднадзор). В соответствии с Положением о Федеральной службе по надзору в сфере природопользования197 к ее полномочиям отнесен прием от юридических лиц и индивидуальных предпринимателей деклараций о плате за негативное воздействие на окружающую среду и осуществление контроля за правильностью исчисления платы, полнотой и своевременностью ее внесения.