Риски наводнений также связаны с метеорологическими и гидрологическими неопределенностями. Наши сегодняшние знания являются неполными, и, в общем, мы недостаточно точно понимаем действующие причинно-следственные гидрометеорологические процессы. Масштабы будущих изменений невозможно предсказать с достаточной точностью, поскольку эти изменения могут быть случайными (изменчивость погоды и климата), систематическими (изменение климата) или квазициклическими (например, явление Эль-Ниньо). В то же время гидрологическая неопределенность, вероятно, зависит от неопределенностей в социальной, экономической и политической сферах, поскольку наибольшие и наименьшее плохо предсказуемые изменения в этих сферах связаны с увеличением численности населения и его экономической деятельностью