Пытаясь использовать церковных педагогов в качестве шпионов и пропагандистов, режим не только дискредитировал систему приходских школ, но и подверг само духовенство революционному насилию
общее количество приходских школ и набор учащихся в них продолжали расти до 1917 года благодаря неуклонной и добровольной поддержке на местах. Институционально они оставались более независимыми от центрального правительства, чем любая из светских школ.
Финансирование приходских школ оставалось в ведении Синода до 20 июня 1917 года, когда Временное правительство прекратило всякое финансирование духовного ведомства в сфере образования
Крестьяне, которым приходилось платить налоги на содержание земской школы, стали гораздо менее охотно вносить добровольные пожертвования на церковно-приходскую
Тем не менее широко распространенная враждебность по отношению к приходским школам создала организационный раскол между религиозной и светской школьными системами, которые фактически дополняли усилия друг друга на поприще народного образования
Священнослужители, преподававшие Закон Божий в светских школах, официально были обязаны следить за другими преподавателями на предмет любых признаков неблагочестия и нелояльности. Впрочем, на практике такого обычно не происходило.
Однако гораздо больший ущерб репутации приходских школ причинила государственная политика, которая, казалось, демонстрировала обоснованность восприятия духовенства как правительственных агентов
учебная программа приходских школ мало отличалась от программы земских школ: «Утвержденные программы церковных школ (1886 г.) и земских школ (1897 г.) были практически идентичны; сравнение программ каждый раз обнаруживало, что церковные и земские школы посвящали каждому предмету почти идентичное время; в церковных школах больше внимания уделялось лишь церковнославянскому языку
К концу XIX века приходские школы оказались под прицелом критики, особенно со стороны либералов и социалистов. Сторонники земских школ изображали приходские школы как казенные учреждения, а значит — как угрозу местной автономии и светскому образованию
Как и их радикальные социалистические оппоненты, приходские клирики использовали городские центры для преодоления изоляции сельских общин и обхода правительственных ограничений на создание ассоциаций