Хотя в этих превращениях не все ясно, уже известно, что активная роль принадлежит каким-то химическим агентам. Они могут быть произведены клетками организма в определенных условиях (например, в результате адаптации организма к физическим нагрузкам, к измененной температуре среды, кислородного состава вдыхаемого газа), или могут поступать в организм извне (например, с едой). Накоплено много сведений о том, как изменения локальной физико-химической среды межклеточной жидкости модифицирует характеристики цитоплазмы и запускает сложные цепи защитных механизмов клетки. Так клетка борется с локальным ухудшением условий ее существования. Но у клетки есть весьма ограниченные ресурсы для восстановления своего нормального существования. Часть произведенных клеткой белков и других молекулярных структур малых размеров способна покидать пределы данной клетки и достигать клеток других специализаций. Благодаря такому дистанционному химическому взаимодействию клеток клетка-инициатор получает «внешнюю помощь». Эта помощь состоит в увеличении притока сырья, необходимого для внутренней перестройки поврежденной клетки и нормализации ее физиологии. Есть данные о том, что даже длительная медитация приводит к эпигенетическим последствиям.