Дело в том, что все высшие психические функции (память, эмоции, мышление и т. д.) играют определенную роль в возникновении и развитии психофизиологических реакций человека под воздействием внешних и внутренних стимулов. Однако собственно процессы памяти не имеют непосредственной связи с теми механизмами функционирования вегетативной нервной системы, внешние проявления активности которых в виде физиологических изменений (реакций) регистрируются с помощью полиграфа. Как справедливо указывают А. Б. Пеленицын, А. П. Сошников и О. В. Жбанкова, дистанция между ними огромна. Есть множество феноменов (психических и физиологических), не позволяющих информации, хранящейся в памяти человека, иметь устойчивое и однозначное отражение во внешних физиологических проявлениях, на основании которых можно было бы делать достоверные выводы как о самом факте наличия этой информации, так и о ее содержании