Второй этап становления вариативного образования продолжался с 1992 до 1998 г. и был сопряжен с распадом СССР. В это время был создан ряд новых типов и видов образовательных учреждений – лицеев, гимназий, колледжей, стала возможной частная инициатива в образовании (частные школы), в содержании и организации учебно-воспитательного процесса в школе педагоги смогли пользоваться модифицированными программами и учебниками