Антитромбин III — наиболее активный из антитромбинов белок. В присутствии гепарина анитромбин III образует прочный неактивный комплекс с тромбином.
Гепарин — гетрополисахарид, синтезируется в тучных клетках, имеет высокий отрицательный заряд, связывается со специфическим катионным участком антитромбина III и др. протеаз, вызывая конформационное изменение их молекулы. Антитромбин III и гепарин взаимодействуют с протеазами и поразнь, при этом ингибирозание менее эффективно, т.к. обратимо. Гепарин в небольшом количестве находится на стенках сосудов, снижая активацию внутреннего пути и препятствуя агрегации тромбоцитов. Таким образом, гепарин проявляет антитромбиновое, антикоагуляционное и антиагрегационное действие в системе гемостаза