В основу проектного обучения, равно как и других разновидностей обучения в сотрудничестве, заложены принципы проведения научного исследования. Подтверждением этого тезиса является то, что деятельность учащихся при работе над проектом проходит в принципе те же этапы, что и при проведении научного исследования: определение проблемы и вытекающих из нее задач исследования; выдвижение гипотезы их решения; обсуждение методов исследования; проведение сбора данных; анализ полученных данных; оформление конечных результатов; подведение итогов выводы.