В результате переселения микрофлоры из толстого кишечника в тонкий, она начинает вести себя как условно-патогенная флора. В итоге нарушается кишечный барьер, повреждается слизистая оболочка, возникает микровоспаление и плохое пищеварение. На длинной дистанции возникают и другие проблемы: нарушение всасывания витаминов, белка, развитие анемии из-за дефицита В12 – этот витамин усиленно кушают микробы. Из-за повышения проницаемости кишечника бактериальные токсины попадают в подслизистый слой и вызывают воспаление кишечника. Одновременно с этим появляется дефицит обычных обитателей кишечника, бифидо- и лактобактерий. Все это всегда будет сопровождаться «обычными» кишечными проявлениями: дискомфортом и урчанием в животе, метеоризмом, нарушениями стула, а также часто отсутствием энергии, усталостью и псевдоаллергическими реакциями.